ساختار فیلوژنتیکی گونۀtrichoderma harzianum جداشده از برخی اقلیم های ایران

نویسندگان

بهار کریمیان

محمد جوان نیکخواه

دوستمراد ظفری

خلیل بردی فتوحی فر

شهرام نعیمی

چکیده

استرین های قارچ trichoderma harzianum به دلیل کاربرد در کنترل بیولوژیک بیماری های گیاهی و تأثیر بر زندگی بشر، اهمیت فراوانی دارند. در تحقیق حاضر، ساختار فیلوژنتیکی این گونه به دست آمده از مناطق جغرافیایی مختلف و زیستگاه های متنوع در برخی اقلیم های ایران (nc، scd و csw) بررسی شد. به منظور بررسی و غربال اولیه، انگشت نگاری 239 جدایۀ به دست آمده از جنس trichoderma با استفاده از نشانگر rapd-pcr انجام گرفت. براساس گروه بندی انجام گرفته، تعدادی جدایه از هر گروه به منظور تعیین توالی ناحیۀ its1-5.8 s-its2 از rdna انتخاب شدند. در مجموع، 176 جدایه از گونۀ t. harzianum به دست آمد. از این میان، 76 جدایه که برای ناحیۀ its آنها تعیین توالی انجام گرفته بود، با روش ماکسیمم پارسیمونی تجزیه وتحلیل فیلوژنتیکی شدند. در نتیجه، این جدایه ها در 10 فیلوتیپ (phylotype) جای گرفتند. فیلوتیپ a با یک جدایه (4414) نمایندۀ آالل جدیدی از its در گونۀ t.harzianum می باشد، که بومی ایران است. یافتن این آلل منحصر به فرد در اقلیم csw در شمال ایران، می تواند بیانگر تأثیر این شرایط اقلیمی در ظهور این آلل جدید در گونۀ t. harzianum باشد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ساختار فیلوژنتیکی گونۀTrichoderma harzianum جداشده از برخی اقلیم‌های ایران

استرین‌های قارچ Trichoderma harzianum به‌دلیل کاربرد در کنترل بیولوژیک بیماری‌های گیاهی و تأثیر بر زندگی بشر، اهمیت فراوانی دارند. در تحقیق حاضر، ساختار فیلوژنتیکی این گونه به‌دست‌آمده از مناطق جغرافیایی مختلف و زیستگاه‌های متنوع در برخی اقلیم‌های ایران (NC، SCD و CSW) بررسی شد. به‌منظور بررسی و غربال اولیه، انگشت‌نگاری 239 جدایۀ به‌دست‌آمده از جنس Trichoderma با استفاده از نشانگر RAPD-PCR انجا...

متن کامل

شناسایی فیلوژنتیکی باکتری‌های اندوفیت جداشده از ریشه بادمجان و بررسی توان آنتاگونیستی آن‌ها

باکتری‌های اندوفیت با توانائی تولید ترکیبات آنتاگونیست، قادر به کنترل بیمارگرهای گیاهی هستند. این مطالعه به منظور بررسی توانایی تولید ترکیبات آنتاگونیستی در باکتری‌های اندوفیت بادمجان انجام پذیرفته است. در این پژوهش باکتری‌های اندوفیت از ریشه بادمجان، جداسازی گردید، سویه‌ها از نظر تولید سیدروفور، هیدروژن سیانید و آنزیم پروتئاز مورد بررسی قرار گرفتند. 5 جدایه برای مطالعات ژنتیکی انتخاب شد. پس از...

متن کامل

گروه‌بندی فیلوژنتیکی برخی جدایه‌های نوکلئوپلی‌هیدروویروس کرم غنچه‌ی توتون (HaNPV) شمال ایران با استفاده از نشانگر RAPD

به‌منظور غربال و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه­های نوکلئوپلی­هدروویروس جمع‌آوری شده از کرم غنچه توتون از برخی مزارع توتون استان‌های مازندران و گلستان، از بین 10 آغازگر RAPD ده جفت بازی ساخت شرکت Operon به‌طور تصادفی ، دو جفت آغازگر OPM-03 و OPM-16 که بیشترین چندشکلی را در بین جدایه‌ها نشان دادند، انتخاب شدند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار PyElph و به‌روش UPGMA انجام و درخت فیلوژنی ...

متن کامل

بررسی ژنومی ساختار جمعیتی و ارتباط فیلوژنتیکی گاومیش نژاد خوزستانی

زمینه مطالعاتی: باتوجه به اهمیت گاومیش در جهت سازگاری با محیط­های خشک، مقاومت در برابر بیماری­ها، پایین بودن هزینه­های نگهداری و استفاده موثر از  مواد خشبی کم ارزش در جهت تولید مواد پروتئینی با ارزش، ارتقا ژنتیکی آن حائز اهمیت فراوانی است. هدف:  این تحقیق به منظور یافتن فواصل ژنتیکی گاومیش­های مناطق مختلف خوزستان و ارتباط ژنتیکی آنها به کمک آرایه چندشکلی تک نوکلئوتیدی اجرا شد. روش کار: در این م...

متن کامل

بررسی محتوای اسیدآمینه ای، ساختار و ارتباطات فیلوژنتیکی توکسین های دیس‎اینتگرین گونه‌های مار افعی

سموم حیوانات حاوی توکسین‌های متعدد با فعالیت‌های فیزیولوژیک مختلف می‌باشند که مشکلاتی همچون واکنش‌های آلرژیک، لخته شدن خون، نکروز، ایست تنفسی ایجاد می‌نمایند. با این حال بررسی‌ها نشان داده است که این سموم می‌توانند به عنوان دارو برای درمان بسیاری از بیماری‌ها مانند سرطان مورد استفاده قرار گیرند. این مولکول‌های زیستی می‌توانند سبب مهار یک پروتئین سلولی، القا آپوپتوز و فرآیندهای دیگر شوند. دیس‌ای...

متن کامل

ارزیابی سازگاری برخی ارقام زیتون (Olea europaea L.) در اقلیم های مختلف ایران

سازگاری نه رقم بومی و وارداتی زیتون در قالب آزمایش اسپلیت‌پلات در زمان، بر پایه طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در چهار ایستگاه تحقیقاتی طارم، رودبار، کازرون و سرپل ذهاب از سال 1383 تا 1387 به مدت پنج سال ارزیابی شد. در این بررسی برخی صفات گل و میوه مانند تعدادگل درگل آذین، درصدگل‌های کامل، وزن میوه، طول و قطر میوه،  نسبت گوشت به هسته،درصد روغن در ماده خشک میوه، عملکردبه درخت و کارآئی عملک...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
دانش گیاهپزشکی ایران

ناشر: پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

ISSN 2008-4781

دوره 45

شماره 1 2014

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023